Quando uma venda é paga com cheque, o sistema dispõe de um controle do processo que permite realizar os lançamentos conforme a situação do cheque.
O primeiro passo é baixar a conta a receber informado os dados do cheque para gerar um registro no cadastro e poder criar as movimentações.
Então, acesse o cadastro de Contas a Receber, localize a conta, clique em Baixar → Baixa Simples
Sempre que for feita baixar com cheque, o sistema exibirá na tela o local para que sejam informados os cheques usados no pagamento daquela conta:
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Após inserir os cheques e confirmar, a conta a receber passará para situação Paga e o controle do cheque ocorrerá através do Cadastro de Cheques Recebidos.
Através desse, é possível realizar todas as movimentações do cheque, sendo que as mesas irão ocorrer através do botão Lançamentos:

Nessa tela é possível alterar as situações do cheque e movimentá-lo de caixa pra outro.
Primeiramente, deverá ser informada qual será a situação do cheque, sendo:
Após selecionar a situação, deve ser informada a data de lançamento e em qual caixa o cheque deverá entrar com essa movimentação, após, é necessário selecionar os cheques que serão movimentados, clicando no botão Novo e informando os dados solicitados.
Caso possua, pode ser utilizada uma leitora para ler o cheque.
Todas as movimentações que realizar, será solicitado que informe um lote, esse campo é de livre digitação, para auxiliar no controle interno.
As movimentações de cada cheque podem ser visualizadas no cadastro do mesmo, na aba Movimentações.

O cheque também pode ser cadastrado clicando no botão Novo do cadastro, as movimentações, seguem da mesma maneira.
Remessa de Cheques
Caso o banco com o qual trabalha disponha do recurso, é possível gerar um arquivo de remessa com os cheques que serão enviados ao banco para depósito ou custódia.
Processos → Remessa de Cheques

Após confirmar, o sistema irá gerar um arquivo de remessa que ficará salvo conforme o que estiver configurado em Cadastros A - I → Bancos na aba Rem/Ret Cheques.
Ao fazer esse procedimento, automaticamente os cheques tem a situação atualizada para depósito ou custódia e também já ocorrem as movimentações nos caixas, sendo uma saída do caixa em que estava e entrada no caixa informado ao gerar o arquivo.
Assim que o cheque é compensado, a operação é finalizada, como a conta a receber já está baixada, não é necessário nenhum outro procedimento.
Quando a situação informada no lançamento do cheque for essa, a conta a receber volta a ficar aberta.
O entendimento é que de o cheque foi enviado ao banco, foi devolvido por algum motivo (dados incorretos, ilegíveis, irregularidade, falta de saldo para compensação...) e o cliente terá de efetuar o pagamento com novo cheque ou outro portador.
Dessa forma, com a conta a receber em aberto novamente, é possível efetuar a baixa com nova forma de pagamento.
É comum que haja mais do que uma tentativa de compensação junto ao banco antes de devolver ao cliente.
Um cheque recebido também pode ser usado para baixar uma conta a pagar, sendo o caso da situação repassado.
No cadastro de contas a pagar, ao baixar a conta e informar o portador cheque, um campo permite selecionar se será utilizado um cheque emitido recebido ou um cheque da empresa.

Ao escolher a opção de cheque de terceiros, você terá que selecionar os cheques que deseja utilizar e confirmar a baixa. Automaticamente, a situação do cheque será alterada para Repassada.
O processo de cheques emitidos é bem semelhante ao de cheques recebidos, a forma de inserção no sistema ocorre através do cadastro ou da baixa de uma conta a pagar.
Ao baixar a conta a pagar, o tipo de cheque selecionado deverá ser o Cheques da Empresa, a mesma tela será exibida para vincular os cheques para baixa dessa conta.
O processo de movimentação de cheques emitidos não ocorre pela mesma tela lançamentos igual aos recebidos, mas a lógica é semelhante, nesse caso, no menu lateral esquerdo, temos as opções para alterar a situação do cheque.
Baixar: compensa o cheque
Cancelar Pagto: Retorna cheque para aberto
Devolver:
Cobrar:
Retorno: para importar arquivo de retorno do banco com cheques emitidos.
Relatório: exibe uma listagem dos cheques com as principais movimentações
Da mesma forma que os cheques recebido, a conta fica como paga e o controle para a ser todo através do cadastro de cheques emitidos.